全自動菌落計數(shù)儀因其使用的自動化程度高、分析結果可核對、樣品信息可留存等，已逐漸被越來越多的科研院所、衛(wèi)生疾控部分所喜愛?，F(xiàn)今面市的所有全自動菌落計數(shù)儀均是采用成像分析法實現(xiàn)自動計數(shù)的，即由成像硬件+分析軟件所組成，這二塊內容的任何一塊上出現(xiàn)失分，都會嚴重影響計數(shù)分析結果的穩(wěn)定性。
 

　　全自動菌落計數(shù)儀的成像硬件用于獲得清晰有效的菌落圖像，以便分析計數(shù)。成像硬件有拍照成像、掃描成像。由CMOS加攝像頭拍照成像的優(yōu)點是：成像速度快，能展現(xiàn)培養(yǎng)基表層和深層的細微菌落。確保在0.5秒內獲得菌落圖像。由單反相機、卡片機拍照成像的優(yōu)點是：能自動對焦、且像素分辨率一般更高，但其成像需要3～4秒的時間。拍照成像的難題是：因光照面到平皿中部與其邊部的距離遠近不同，導致平皿面上各點的亮度不一致。因此，需由軟件來自動矯正。需指出的是：暗視野僅是成像的一種方式，其現(xiàn)象是目標呈懸浮狀態(tài)，早在幾十年就已經(jīng)出現(xiàn)了。
 

　　全自動菌落計數(shù)儀的分析軟件是全自動菌落計數(shù)儀的另一塊核心成分。因為菌落生物的存在多樣性，在培養(yǎng)基上的表現(xiàn)或顯像不可能大體一致，針對這類變化，在分析軟件選型上要考慮以下幾方面：
 

　　1.菌落智能識別技術(能自學習以形成一鍵式操作的，更好)、粘連菌落分割、菌落形態(tài)學分析、區(qū)域選擇統(tǒng)計、直徑分類統(tǒng)計、鼠標單擊計數(shù)、顏色識別統(tǒng)計、人工計數(shù)修正、排除污染區(qū)域計數(shù)、自動換算功能、自動雜質剔除；
 

　　2.自動分析菌落直徑、面積等精確測量長度、角度、面積等測量功能；
 

　　3.數(shù)據(jù)自動存儲、查詢、Excel導出報表打印等；
 

　　4.抑菌圈測量、紙片法藥敏分析、多培養(yǎng)皿分析、螺旋平皿分析。